与えられたa，bは正の整数です。a,bの最大公約数を求めます。
フローチャートは、情報処理技術者試験（H29春AP問６）にあります。

終了時にxに格納されているものが、最大公約数です。
※mod(x,y)はxをyで割った余りです。
H29h-問6
たとえば、以下の数字で考えます。
x=20、y=25

■ループ１：t=20、x=25、y=20
■ループ2：t=5、x=20、y=5
■ループ3：t=0、x=5、y=0　←ループ終了

終了時にはxに、a（20）とb（25）の最大公約数である5が入ります。

プログラム
実際にCでプログラムを書いてみると、以下のようになります。
#include <stdio.h>

//mod関数（"x"を"y"で割った余りを計算する）
int mod(int x, int y)
{
 //"%"は余りを計算する演算子
 return x%y;  //"x"を"y"で割った余りを返す
}

//main関数
void main(){
 int x, y;
 int t;   // 余りを入れる

 //標準入力からxとyの値を取得
 printf("整数aを入力してください:");
 scanf("%d", &x);
 printf("整数bを入力してください:");
 scanf("%d", &y);

 //while文で"y"が0以外の場合はループ１を実施
 while(y!=0){
  t = mod(x, y);  //定義したmod関数の戻り値を"t"に代入
  x = y;  //"y"の値を"x"に代入
  y = t;  //"t"の値を"y"に代入
 }

 printf("x=%dです\n", x);
}

プログラム（ｘとyの入力チェックを含めた少し詳細なもの）
#include <stdio.h>

int mod(int x, int y)
{
 return x%y;
}

void main(){
 int x, y;
 int t;

 printf("input x:");
 if(scanf("%d", &x)!=1){  //数値の取得に失敗した場合
  printf("入力エラー\n");
  return;  //プログラムの途中終了
 }

 if(x<=0){  //xが正の整数で無い場合
  printf("数値が不正です\n");   //プログラムの途中終了
  return;
 }

 printf("input y:");

 if(scanf("%d", &y)!=1){
  printf("入力エラー\n");
  return;
 }

 if(y<=0){
  printf("数値が不正です\n");
  return;
 }

 while(y!=0){
  t = mod(x, y);
  x = y;
  y = t;
 }

 printf("x=%dです\n", x);

}